结核科是上海市结核病诊治定点医院之一，是上海市儿童结核病的唯一定点收治医院。
科室建立了完整的结核病诊断治疗和管理方案，在肺结核（药物敏感肺结核、耐药肺结核）、儿童结核病、儿童卡介苗接种相关不良反应、肺外结核（如淋巴结核、骨结核、结核性脑膜炎、肾结核、生殖系统结核、结核性胸膜炎、结核性腹膜炎、肠结核、腹腔结核、盆腔结核、皮肤结核、结核风湿症等）、结核共患病（如肝病合并结核、肾功能不全合并结核、风湿结缔组织病合并结核、器官移植合并结核，糖尿病合并结核、妊娠合并结核、免疫缺陷合并结核等）、非结核分枝杆菌病等多种疾病的诊疗、鉴别诊断具有独到之处。在学校与儿童结核病防治、危重症结核病救治具备丰富临床经验。同时，在其它呼吸系统疾病诊疗方面也具有丰富经验。
近年来，科室发表学术论文60余篇。承担国家“十三五”传染病科技重大专项、国家自然科学基金、上海市强主体重点专科建设项目、上海市科委、申康发展中心三年行动计划等多项结核病领域重要研究。主要涉及结核病的快速诊断，结核病新型疫苗、结核病相关宿主免疫缺陷研究，结核相关药物临床试验、重症肺炎的救治等。
收治病种有肺结核、肺外结核、儿童结核病、妊娠结核病、播散性卡介菌病及结核病合并全身其他疾病，如结核病合并肝病、结核病合并糖尿病、结核病合并肾病、结核病合并恶性血液系统疾病等；在危重症结核病及难治性结核病救治方面积累了丰富的临床经验，比如结核性脑膜炎、重症肺结核、播散性卡介菌病、耐多药结核病等的救治。结核科自建科以来致力于结核病的快速确诊及个体化治疗，结核科临床一线人员与中心的结核团队其他成员包括病理、超声及影像、检验、外科以及科研团队成员一起精诚协作，在肺结核、肺外结核病的诊断及治疗方面具有较大的优势。同时对重症病毒性肺炎、肺部真菌感染等其他肺部感染性疾病、慢性阻塞性肺病、自发性气胸、支气管哮喘、支气管扩张、肺脓肿、脓胸、肺部肿瘤等疾病的诊断、鉴别诊断及治疗方面也具有丰富的经验。在2009年甲型H1N1流感及2013年H7N9禽流感的救治方面积累了宝贵的实战经验。
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