检验医学科 2004 年随原市传染病医院迁金山，保留市区门诊并一体化管理。检验科医学严格按照医学实验室生物安全Ⅱ级（BSL-2）的要求设计，并配备微生物流水线、质谱仪、电化学发光免疫分析仪等先进的自动化仪器，网络化和智能化的信息管理体系。检验科下设临床生物化学、临床免疫学、临床微生物学、临床血液学/体液学/输血和基因扩增及结核组6个检验专业组，并配备了分析前、后处理等保障体系。2010 年 4 月，上海首批通过 CNAS ISO15189 认可的实验室之一，同时，检验科参加国家和上海市临床检验中心的室间质评，有能力提供具有良好准确性和溯源性的检验结果。
从1988年甲肝、2003年SARS、2008年手足口、2009年甲流、2013年H7N9、2014年埃博拉、2015年MERS、2020年的新冠再到2023年猴痘，检验医学科一直走在传染病诊断和应急防控的前列，历次承担的世博会、进博会等重大公共卫生应急保障任务。制定的《埃博拉病例标本临床检验的实验室生物安全操作规程》被采纳为行业指南。
重视人才与学科建设，拥有合理人才梯队，承担多院校教学培训任务。科室具有婴幼儿艾滋病早筛实验室、HIV确证实验室、市级结核病检测实验室等平台，在传染病病原体诊断、疑难感染病诊断和鉴别诊断和重症发病预警机制等领域特色突出，支撑多个重点中心建设，近年来科室主持二十余项课题，发表七十余篇论文。
检验科先后获得“全国五一巾帼奖状”、“全国五一巾帼标兵岗”、“上海市抗击新冠病毒肺炎疫情先进集体”和“上海市卫生健康系统三八红旗集体”等荣誉称号。目前正提升重大及新发传染病病原诊断能力，发展前沿技术，致力打造感染病精准检验高地，成为国内相关临床实验诊断中心。
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